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黑龙江11选5号码:
BIOTREE | 第21期代謝組學及數據分析培訓班圓滿結束

分類:
阿趣動態
發布時間:
2019/07/29 14:11
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代謝組學
 
7月22日上午9:00,60余位來自全國各地的代謝組學研究領域的老師和同學冒著酷暑來到上海阿趣生物科技有限公司(以下簡稱BIOTREE)參加由BIOTREE與Sartorius Stedim 共同舉辦的第21期代謝組學及數據分析培訓班。
 
本次培訓班特別邀請了在代謝組學領域的知名專家:上海交通大學呂海濤老師、江南大學紀劍老師、上海生命科學研究院營養科學研究所陶用珍老師,以及BIOTREE資深技術老師前來授課。他們分別圍繞代謝組學發展史及技術介紹、課題設計、代謝流技術、樣本采集及預處理、多元變量統計分析等方面進行了全方位的解析??緯棠諶菝婷婢愕?,精彩紛呈,將理論知識、經典案例加以結合,讓學員充分地理解和掌握代謝組學科研方面的核心要點、操作流程及注意事項。
 
培訓期間,學員們都非常認真地對待這次學習機會,積極地在代謝組學的研究思路、方法及多變量統計的方法等方面進行了深入的探討。
 
PS. 由于各種原因無法前來參加本次培訓的各位老師也不用著急,8月17日我們將在廣州第22期培訓班上為大家繼續帶來精彩的課程!
 
最后,讓我們一起來回顧一下本次培訓班的精彩瞬間吧~
 
開班致辭
 
代謝組學
 
BIOTREE CEO 鄧軍亮老師代表BIOTREE全體員工對本次蒞臨參加培訓的各位嘉賓和學員表示最熱烈的歡迎。
 
今年是自BIOTREE 2012年創辦以來步過的第8個年頭。在這八年之間, BIOTREE已成長為一個超100人的專業科研團隊,并通過開辦培訓班培養了行業內近1000名的儲備人才;同時,BIOTREE已在上海建立了屬于自己的開發服務中心和產品研發中心。作為一個有情懷的公司,BIOTREE希望將在科研上做出的成果,最終轉化為對社會有用的產品,為社會多貢獻一份力量。
 
另外,由BIOTREE獨家引進的大數據分析標桿產品SIMCA 16版本已正式上線,增加新技術MOCA (Mulitiblock Orthogonal Component Analysis)可實現多組學數據聯合分析。當然由BIOTREE研發的MAPS 1.0系統也已上線且功能已經非常齊全,可以為大家在代謝組學全流程(實驗操作、數據解析等)相關需求上提供較為完善的解決方案;與此同時,BIOTREE還和南京揚子科創合作,將一起打造全球頂級的質譜檢測中心。
 
創業維艱,BIOTREE一直在路上,非常榮幸能遇到大家,感謝大家這一路上的信任與支持。
望大家在本次培訓中:“學有所得,得有所用,用有所成”。
引用喬布斯的一句話:“Stay Hungry(虛懷若谷)Stay Foolish (大智若愚)”。
 
插播一條小廣告:
歡迎大家加入BIOTREE;
學完我們所有培訓課程的學員可以免試入職喲~
 
言歸正傳,
讓我們一起來看看各個課程的精彩點滴吧!
 
01
代謝組學及多元變量統計分析
(7/22-7/23)
 
01
嘉賓:呂海濤
上海交通大學
系統生物醫學研究院研究員 
功能代謝組科學實驗室負責人
 
代謝組學
 
主題:代謝組學概述與發展
 
本次課程中,呂海濤老師從代謝物的定義、代謝組學的發展史、代謝組學在生命科學中的應用、研究檢測代謝相關物質的器械分類及其檢測原理;另外,對靶向、非靶向代謝學的研究方向、儀器、分類等多個方面詮釋了代謝組學在如今社會上的發展、應用與貢獻。
 
02
嘉賓:劉志鵬
BIOTREE 資深研究員
 
代謝組學
 
主題:代謝物溯源在腸道微生態中的研究應用
 
本次課程中,劉志鵬老師講述了宏基因組學的定義、腸道微生物代謝及其發展趨勢和取得的成就。重點介紹了腸道微生物通過產生相應代謝物后發揮的作用,并以案例分享的方式對研究腸道微生物代謝物的方法與思路進行了詮釋。
 
03
嘉賓:陶用珍
中科院上海營養所副研究員
主題:代謝流技術的簡介及應用
 
代謝組學
 
本次課程中,陶用珍老師主要講解了三個部分的內容,分別是:代謝流的原理和定義;樣品制備方法以及如何設計特殊的標記物監測胞內外代謝流量的變化;C13 和 N15 代謝流分析在人類重大疾病中的應用及相關例證。
 
04
嘉賓:袁曉芳
BIOTREE 技術支持主管
 
代謝組學
 
主題:代謝組學樣本收集與前處理方法
 
本次課程中,袁曉芳老師主要介紹了代謝組學研究中的樣本收集與處理方法。從不同的樣本類型入手,深入且細致地介紹:樣本分類、常見的收集方法和遇到的問題、樣本收集過程中的通用原則、樣本儲存及寄送注意事項。同時列舉了樣本收集處理寄送的實例為大家提供更加明確且真實的操作講解。
 
05
嘉賓:吳洪強
BIOTREE CTO
 
代謝組學
 
主題:
01_MAPS-代謝組學分析平臺構建全流程解決方案: 
 
吳洪強老師詳細介紹了MAPS系統的構架原理:從樣本到數據采集、到數據庫、生信分析全流程覆蓋。隨后由杜杰老師為大家演示了數據處理、統計分析、功能分析等相關操作及注意事項。
 
02_非靶標、靶標、高通量靶標、及廣泛靶標技術簡介:
 
吳洪強老師為大家深入介紹了多種代謝組學技術的詳解與對比(包括非靶標、靶標、高通量靶標、廣泛靶標)從硬件的色譜-質譜聯用儀,物質偏好(氣態、液態或重疊)到各個代謝組學的研究技術的詳細方法、難點、應用方向都一一進行了闡述與舉例。
 
06
嘉賓:紀劍
江南大學副研究員
 
代謝組學
 
主題:GC-MS代謝組學下機數據分析
 
本次課程中,紀劍老師就GC-MS代謝組學的下機數據分析流程進行了詳盡的數據實操講解,其包括:CG-MS原始數據、數據類型及格式轉換、噪音及基線矯正、提峰與解卷積、鋒對齊、空值填補、及物質定性等。每個流程中都例舉了相應的優化數據的方法與實例。
 
07
嘉賓:杜杰
BIOTREE 生物信息經理
 
代謝組學
 
主題:多元變量統計分析
 
本次課程中,杜杰老師就大數據與多元變量統計的重要性進行了詳細的解讀與闡述。對大數據的定義及3大特點、SIMCA系統的演化更新、代謝組學數據分析流程進行了詳盡的實例分析與答疑。最后與參加培訓的老師與學員們進行了SIMCA軟件的實際操作流程演練,使學員們初步掌握了SIMCA軟件的運用。
 
02
DOE Course 實驗設計課程
(7/22-7/23)
 
嘉賓:David Wang
Sartorius Stedim Data Analytics AB
Senior Application Specialist
 
代謝組學
 
簡介:
Wang就任于新加坡Sartorius Stedim Data Analytics AB公司,作為資深應用專家主要致力于SIMCA/MODDE等相關軟件等技術應用及支持,其工作重點是數據驅動的工藝建模、工藝監控、工藝控制、實驗設計、數據分析、OMICS、PAT和QbD。撰寫過60多份期刊論文和會議出版物,并在第四屆IEEE工業信息學國際會議上榮獲最佳論文獎。
 
代謝組學
 
主題:DOE 課程
 
本次為期2天的DOE(實驗設計)培訓中, David主講內容有:DOE在科學領域的應用和DOE中的數據分析步驟;全因子設計思路流程;同時針對以下:Bioassay Optimization(生物測定優化)、Desirability Function(合意性/期望函數)、D-optimal Design(D-最優設計)、GSD in Multivariate Calibration (多元校正中的廣義子集設計)、Mixture Design(混料實驗設計)、Stability Testing(穩定性測試)、Theory Fractional Factorial Design(部分要因實驗設計理論)等多種設計類型及理論化流程分析,提供了相應的課程練習與實例分析,運用點到面的教學方式讓參加培訓的各位學員由淺到深地了解了實驗設計的原理、流程和相關思路。
 
03
GC/LC 原始數據預處理實操
(7/24)
 
嘉賓:紀劍
江南大學副研究員
 
代謝組學
 
主題:GC/LC 原始數據預處理實操分析
 
紀劍老師著重講解了在非靶標代謝物測試上運用GC-MS/LC-MS的原因,運用思路。并對相應軟件MS DIAL做了非常細致周全的介紹及不同供應商的LC-MS數據轉換;同時還為大家介紹了物質鑒定的方法及難點、Mona數據庫的使用、msp數據庫的使用。為了讓大家更加深刻地理解本次課程的要領,紀劍老師和學員們一起演練了相關的實戰練習:Unknown物質鑒定中的分子式確定和結構式確定方法及流程。
 
04
可視化作圖代謝通路網絡構建分析
(7/25-7/26)
 
01
嘉賓:紀劍
江南大學副研究員
 
代謝組學
 
主題:代謝通路網絡構建分析
 
紀劍老師詳細介紹了相關軟件Cytoscape等的功能及運用細節,并對兩個軟件在代謝通路分析上的運用做了全面的演示和實戰練習。紀劍老師和學員們進行了大量的實際操作訓練,以加強大家對相關知識內容的熟悉度。
 
02
嘉賓:杜杰
BIOTREE 生物信息經理
 
代謝組學
 
主題:可視化作圖
 
杜杰老師綜合敘述了層次聚類法,帶領大家學習了層次聚類法熱力圖-MEV軟件的學習及應用,并做了相關的案例演練。接著進行了對代謝通路分析中運用到的MetaboAnalyst網站、ROC曲線、箱式圖案例等進行了更為全面的講解。最后向大家介紹了KEGG網站并演練相關的案例分析。
 
05
MVDA for Research
(數據實操課程)
(7/27-7/28)
 
嘉賓:杜杰
BIOTREE 生物信息經理
 
代謝組學
 
主題:MVDA for Research
 
本次主題為SIMCA進階實操課程,杜杰老師主要的課程涵蓋內容包括:PCA/OPLS-DA/PCA-Class、O2PLS與解讀、潛在小分子生物標記物發現、多組學關聯模型分析。
 
結語
 
大家仔細地聆聽,認真地記錄,積極地討論,懷著一個空杯的心態和BIOTREE一同度過了一周的學習時光。相信大家在這樣一個干貨滿滿的培訓課程中,定是學有所得,望大家在之后的學習研究中可以得有所用,用有所成。
 
感謝各位嘉賓老師的蒞臨與悉心講解;再次感謝各位學員的到來;希望有機會再和大家一起交流學習。
 
精彩仍會繼續,我們8月17日廣州第22期培訓班再見?。?!
 
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BIOTREE | 第21期代謝組學及數據分析培訓班圓滿結束