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靶標代謝流分析

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黑龙江11选5前3直遗漏值 www.ndmwkc.com.cn 基于13C或者15N標記的靶標代謝流分析能夠系統地定量細胞或者組織內特定代謝通路代謝網絡的流量分布及各代謝途徑的相對貢獻,其優點是可以利用細胞內代謝物的質量同位體信息的分析方法,不但在很多情況下能夠直觀地表明代謝流量的整體走向,而且通過計算能夠準確定量地揭示細胞內各個代謝反應的活性,以及深入理解平行反應、可逆反應等多種復雜的細胞內代謝過程,直觀揭示細胞胞內的主要活性途徑及各個途徑的相對貢獻及其分布變化特點,從而鑒定出相關疾病發生發展過程的早期診斷的標志物及其關鍵的主要代謝通路,并揭示其相互調控規律,為疾病發生的臨床早期診斷、藥物靶點治療和預后判斷提供強有力的科學依據。

 

技術優勢

技術成熟、靈敏度高;
專業的數據分析團隊,通過Matlab flux-8等軟件進行原始數據處理,并進行PCA、柱狀圖、熱力圖、Bi-plot等分析。
 
技術路線
 

技術參數

樣本要求
細胞 1×107 cells/sample
 
生物學重復
6-10個生物學重復
 
檢測平臺
GC-Q-MS(Shimadzu Qp2010 Ultra)
 
檢測范圍
基于13C 標記的葡萄糖(Glucose)碳代謝流分析
基于13C標記的谷氨酰胺(Glutamine)碳代謝流分析
基于15N標記的谷氨酰胺(Glutamine)氮代謝流分析
 
常規項目周期
實驗檢測:40個工作日(從收到客戶預付款并收到樣品之日起)
數據分析:5個工作日
 
應用方向
1、通過比較不同環境條件及各種代謝性疾病的不同代謝途徑的代謝流量的分布變化,揭示出相關疾病發生發展過程中的主要代謝通路及其早期診斷的標志物;
2、通過13C代謝流量技術對胞內外的中間代謝物的變化示蹤,可以鑒定出基因工程菌的關鍵的代謝通路和活性,為提高目標代謝產物的合成提供直接的依據;
3、可以比較分析細胞,組織及其血樣和尿液在基因改造的前后的代謝功能變化。
 
案例分析
腫瘤細胞代謝重編程
腫瘤細胞具有高能量和合成代謝的需求,才能適應其自身的代謝情況在營養脅迫條件下存活并保持增殖。根據這項研究,PKCζ缺失會促進癌細胞進行代謝重編程,從而在葡萄糖缺乏的條件下通過調控絲氨酸合成途徑去利用另外一種營養物質-谷氨酰胺。PKCζ可以抑制該通路中兩種關鍵酶PHGDH和PSAT1的表達,并且通過磷酸化PHGDH抑制其酶活性。研究人員發現,小鼠中的PKCζ缺失也會增加腸道腫瘤的發生并提高這兩種代謝酶的表達,與此同時低水平PKCζ患者預后較差。此外在人的腸道腫瘤中,PKCζ和caspase-3的活性與PHGDH有關。這些結論揭示了腫瘤代謝酶抑制劑PKCζ在人類癌癥中的關鍵作用。
 
參考文獻
Li Ma, Yongzhen Tao,et al.Control of Nutrient Stress-Induced Metabolic Reprogramming by PKCz in Tumorigenesis.cell,2013,152: 599–611.